金刚顶经瑜伽有十万偈十八会，初会名一切如来真实摄教王，有四大品：一名金刚界，二名降三世，三名遍调伏，四名一切义成就表四智印。于初品中有六曼茶罗，所谓金刚界大曼茶罗，并说毘卢遮那佛受用身，以五相现成等正觉(五相者所谓通达本心、修菩提心、成金刚心、证金刚身、佛身圆满，此则五智通达)，成佛后以金刚三摩地现發，生三十七智，广说曼荼罗仪则，为弟子受速证菩萨地佛地法。第二说陀罗尼曼茶罗，具三十七，此中圣众皆住波罗蜜形，广说入曼茶罗仪轨，为弟子受四种眼，说敬爱、钩召、降伏、息灾等仪轨。第三说微细金刚曼茶罗，亦具三十七圣众，于金刚杵中画，各持定印，广说入曼茶罗仪轨，为弟子令心堪任、令心调柔、令心自在，说微细金刚三摩地，修四静虑法、修四无量心及三解脱门。第四说一切如来广大供养羯磨曼茶罗，亦具三十七，彼中圣众，各持本幖帜，供养而住，广说入曼茶罗法，为弟子说受十六大供养法，说四种秘密供养法。第五说四印曼茶罗法，弟子受四种速成就法，以此曼茶罗求悉地成就，像如上四曼茶罗中所求悉地，于此像前求成就。

第六说一印曼茶罗，若持毘卢遮那真言及金刚萨埵菩萨具十七尊，余皆具十三，亦说入曼茶罗仪，与弟子受先行法，修集本尊三摩地。

次说降三世大品，有六曼茶罗，如来成等正觉已，于须弥卢顶转金刚界轮已，与诸菩萨名号受职已，摩醯首罗等刚强难化，不可以寂静法而受化。尽虚空遍法界一切如来异口同音，请以一百八名赞礼金刚萨埵。如是诸天不可以寂静法而受化，时金刚手菩萨受一切如来请已，即入悲怒金刚三摩地，现大威德身，以种种方便调伏，乃至命终。摩醯首罗死已，自见于下方过六十二恒河沙世界，名灰庄严，彼世界中成等正觉，名为怖畏自在王如来。执金刚菩萨以脚按之，诵金刚寿命真言，复得苏。既受化已，金刚萨埵则说大曼茶罗，引入诸天，受金刚名号诸天有五类。

居上界天王，摩醯首罗等无量诸天及后。

第二游虚空诸天，日天子等无量诸天及后。

第三居虚空天，魔王等无量诸天及后。

第四地居天，主藏天等无量诸天及后。

第五地下嚩啰呬天等无量诸天及后。悉皆引入已，勅诸天建立诸曼茶罗，汝等赴会，所求一切悉地皆与成办，此等皆是外金刚部。

第一说大曼茶罗仪则，皆具三十七，说降伏法及修神通法。

第二说秘密曼茶罗，具三十七，说引弟子仪，此中诸音声及金刚歌舞。

第三说法曼茶罗，具三十七，说引入弟子仪，此中说以慈悲喜舍，作阿毘遮噜迦法，微细金刚调心仪轨。

第四说羯磨曼茶罗，具三十七，说入曼茶罗仪，令弟子学护摩仪轨，于无量佛菩萨所，成广大供养，速得悉地现前，说二十五种护摩炉随类所求法。

第五说四印曼茶罗，具二十一，成就诸药法等。已上四曼茶罗中成就法，于此曼茶罗中成就法于此曼茶罗像前求。

第六说一印曼茶罗，具十七，说引入弟子及先行法。

次为外金刚部众，说四种曼茶罗，各说本真言、本印契献佛。佛为说教勅大曼茶罗，具三十七，说引入弟子仪，说为弟子使役外金刚部轨则，此中说大佛顶及光聚佛顶真言及契，亦通一字顶轮法。

次说第二教勅三昧耶曼茶罗，彼诸天后等各献本真言，佛为说曼茶罗，具三十七，说为弟子说修药叉药叉女法，广说诸仪轨。

次第三说教勅法曼茶罗，诸天说真言献佛，佛为彼等说曼茶罗，具三十七，说引入弟子仪，为弟子说诸天之法印已，由此印不违越本誓。

次第四说教勅羯磨曼茶罗，具三十七，说引入弟子仪。彼等诸天各说本真言，佛为说曼茶罗，说诸天舞仪，说成就诸事业速疾法。

次说遍调伏大品，有六种曼茶罗。

第一大曼茶罗，具三十七，皆观自在菩萨变现，说引入弟子仪，此中说十六种成就速疾神通三摩地仪。

第二说三昧耶曼茶罗，具三十七，皆观自在菩萨变现，说引入弟子仪，此中说钩召、敬爱十六种三摩地。

第三说法曼茶罗，具三十七，皆观自在菩萨变现，说引入弟子仪，此中说修心及求智慧辩才法十六种。

第四说羯磨曼茶罗，具三十七，皆观自在菩萨变现，说引入弟子仪，此中说莲花部供养仪，及转罪障报障、盖缠业障法。

第五说莲花部四印曼茶罗，具二十一，皆观自在菩萨变现，说引入弟子仪，此中说成就，先行法及成就先行如上四种曼茶罗法。

第六说莲花部中一印曼茶罗，具十三，皆观自在菩萨变现，说引入弟子仪，此中说修本尊法，通修世间出世间法。

次说一切义成就大品中，有六曼茶罗。第一大曼茶罗，具三十七，此中说引入弟子仪，由入此曼茶罗，除贫匮业，说求丰财，求佛菩萨位及世间荣位。

第二秘密三昧耶曼茶罗，具三十七，此中说引入弟子仪，说求伏藏法，速满檀波罗蜜福德聚法。

第三法曼茶罗，具三十七，此中说引入弟子仪，说宝部中修三摩地法，令心安住、令心堪任、令心调柔、令心自在，见虚空藏菩萨法。

第四羯磨曼茶罗，具三十七，此中说引入弟子仪，说加持掘伏藏事业法，并说宝部中广大供养诸佛仪。

第五四印曼茶罗，具二十一，说引入弟子仪，说修先行法，及说四曼茶罗中悉地法。

第六一印曼茶罗，具十三，说引入弟子仪，说修一尊法，及修诸药等三摩地，皆是则彼婆伽梵执金刚虚空藏变化。次都说如前一一曼茶罗中，秘密助成方便散诵。次后示释迦牟尼佛，降于阎浮提，变化身八相成道，皆是普贤菩萨幻化，一切如来还以一百八名，赞扬金刚萨埵。如是第一会。

次说第二会，名一切如来秘密王瑜伽，于色究竟天说。具四大品，广说微细实相理，及广说降摩醯首罗、摩醯首罗天，以偈与金刚菩萨酬答。

次说第三会，名一切教集瑜伽，于法界宫殿说。一切如来异口同音，问金刚萨埵菩萨一百八问，金刚萨埵菩萨一一答。此经中说大曼茶罗五部，一一部中五曼茶罗，各具三十七，都成一大曼茶罗。一一尊各各说四印，所谓大印、三昧耶印、法印、羯磨印，各说成就法，此经中说一百二十五种护摩炉，一一炉所求各异。

次说第四会，名降三世金刚瑜伽，于须弥卢顶说。金刚藏等八大菩萨，一一尊各说四种曼茶罗，初会说降伏摩醯首罗及诸天入曼茶罗授职位授名号四种曼茶罗，所谓大曼茶罗、三昧耶曼茶罗、法曼茶罗、羯磨曼茶罗，及一一尊说引入弟子仪及成就法，后都说诸尊三昧耶结印次第，及说秘密禁戒及秘密修行。

第五会名世间出世间金刚瑜伽，于波罗奈国空界中，略说五佛曼茶罗，及诸菩萨诸外金刚部曼茶罗，一一曼茶罗具四种，各说引入弟子仪及求悉地法。

第六会名大安乐不空三昧耶真实瑜伽，于他化自在天宫说。此经中说普贤菩萨曼茶罗，次说毘卢遮那曼茶罗，次后说金刚藏等，至金刚拳菩萨及外金刚部，说般若理趣。一一尊具说四种曼茶罗，各说引入弟子仪，授理趣般若波罗蜜多法及受四种印法，品中各说求世间出世间悉地法。

第七会名普贤瑜伽，于普贤菩萨宫殿中说。此经中说普贤菩萨等，至金刚拳菩萨及外金刚部，一一尊各说四种曼茶罗，说引入弟子仪，说受四种印，修世间出世间悉地。此经中说修行人无时无方，不依世间禁戒，以菩提心为先，无为戒为本。

第八会名胜初瑜伽，于普贤宫殿说。普贤菩萨等，至外金刚部，各各说四种曼茶罗，说实相理，及分別诸曼茶罗仪则，稍广于第七会，说大略同。

第九会名一切佛集会拏吉尼戒网瑜伽，于真言宫殿说。此中说立自身为本尊瑜伽，诃身外主形像瑜伽者，广说实相理，并说五部根源，并说瑜伽法具九味，所谓华丽(金刚萨埵)、勇健(毘卢遮那)、大悲(持金刚)、喜笑(观自在)、嗔怒(金刚光)、恐怖(降三世)、厌患(释迦牟尼佛)、奇特(金刚笑)、寂静(瑜伽中毘卢遮那)。说普贤菩萨等，至金刚拳，各说四种曼茶罗，及引入弟子仪，及受四种印，并说五部中歌赞舞仪。

第十会名大三昧耶瑜伽，于法界宫殿说。普贤菩萨等，至金刚拳菩萨十六大菩萨，各各说四种曼茶罗，说引入弟子仪，受四种印法。此中说偈云：

第十一会名大乘现证瑜伽，于阿迦尼咤天说。毘卢遮那佛等，至金刚毘首羯磨菩萨，及八大供养四摄出生同真实摄瑜伽，一一尊具四种曼茶罗四种印，广说实相理心建立曼茶罗仪则。

第十二会名三昧耶最胜瑜伽，于空界菩提场说。毘卢遮那等四部中上首菩萨，金刚拳等八菩萨及外金刚部，各各说四种曼荼罗四印等八。此经中，于自身上建立曼荼罗，说自身本尊瑜伽，广说阿字门通达于染净，有为无为无碍。

第十三会名大三昧耶真实瑜伽，于金刚界曼荼罗道场说。十方一切佛异口同音，请金刚萨埵，唯愿说三昧耶真实教法，我等先已受讫，唯愿金刚萨埵为诸菩萨。既授请已，说普贤菩萨十七字真言，说适悦不空曼荼罗，具十七，亦说四种曼荼罗，说一百八道契，说通求世间出世间悉地。随此诸菩萨及外金刚部，各各说本曼荼罗本真言本契印竟，普贤菩萨说秘密中曼荼罗十七尊支分，各复入本尊身，共成五尊，同居一莲花台，说一字真言，从眼口及一切支分变异即成印，但住大印结羯磨印，不待先行不籍结护加持，亦不假迎请，宿业罪障不能陵逼，亦不障碍速疾成就。

第十四会名如来三昧耶真实瑜伽，此经中普贤菩萨十六大菩萨，四摄成一身，说四种曼荼罗四印，广说五部互圆融，如来部即金刚，莲花部即宝部，互相涉入，法界即真如，般若即实际，于假施设有异，于本即一体。次普贤后诸菩萨及外金刚部，各各说本真言、本曼荼罗、本印契。

第十五会名秘密集会瑜伽，于秘密处说，所谓喻师婆伽处说，号般若波罗蜜宫。此中说教法坛印契真言，住禁戒，似如世间贪染相应语。会中除盖障菩萨等从座而起，礼佛白言：「世尊大人不应出麁言杂染相应语。」佛言：「汝等清净相应语，有何相状？我之此语，加持文字，应化缘方便，引入佛道，亦无相状，成大利益，汝等不应生疑。」从此广说实相三摩地，诸菩萨各各说四种曼荼罗四印。

第十六会名无二平等瑜伽，于法界宫说。毘卢遮那佛及诸菩萨并外金刚部等，各各说四种曼荼罗，具四印，此中说生死涅槃、世间出世间、自他平等无二种心，举目声香味触杂染思虑住乱心无二，同真如法界，皆成一切佛身。

第十七会名如虚空瑜伽，住实际宫殿说。毘卢遮那佛、普贤菩萨及外金刚部，一一说四种曼荼罗，具四种印。此中修行者，与一一尊相应，皆量同虚空法身相应，离一切万物，法体光明量同虚空无来无去。此经中说虚空三摩地相应法。

第十八会名金刚宝冠瑜伽，于第四静虑天。金刚萨埵菩萨请佛，为大梵天娑诃世界主说五部瑜伽曼荼罗引入弟子仪，具三十七，亦说四种曼荼罗，具四印。下至外金刚部，为弟子受学心念诵，于月轮上右旋列真言字，注心于一一字，实相理相应，周而复始，亦通成就世间出世间悉地，不假持珠遍数以为剂限，但证理门心不散动，住本尊瑜伽为限。此经中微细说不成就二十种相，及说隣近悉地多种相。

瑜伽教十八会，或四千颂或五千颂或七千颂，都成十万颂，具五部四种曼荼罗四印，具三十七尊，一一部具三十七，乃至一尊成三十七，亦具四曼荼罗四印，互相涉入，如帝释网珠光明交映展转无限。修行者善达此瑜伽中大意，如遍照佛，一一身分、一一毛孔、一一相、一一随形好、一一福德资粮、一一智慧资粮，住于果位，演说瑜伽二乘不共佛法，说曼荼罗三昧耶法门事业，量同虚空，证者如上所说，各各分剂各不杂乱，圆证四身，所谓自性身、受用身、变化身、等流身，是能顿作利乐一切有情、诸菩萨声闻缘觉及诸外道，名瑜伽金刚乘教法。