《瑜伽本经》都十万偈，有十八会，初会经名〈一切如来真实摄〉，其经说五部：佛部(毘卢遮那佛以为部主)、金刚部(阿閦佛为部主)、宝部(宝生佛以为部主)、莲花部(阿弥陀佛以为部主)、羯磨部(不空成就佛以为部主)。彼五部主，各有四菩萨以为眷属，前右左背而安列。四内供养各属四部，次第应知。四外供养亦属四部，四门钩索锁铃，四部次第应知。
复有五类成二十，五类者上界四天。
瑜伽部曼茶罗有四：一、金刚界；二、降三世；三、遍调伏；四、一切义成就。此四曼茶罗，表毘卢遮那佛内四智菩萨，谓金刚灌顶莲花羯磨为四智。
又四智谓：大圆镜、平等性、妙观察、成所作为四智矣。又一一曼茶罗，建立六曼茶罗，所谓：大曼茶罗、三昧耶曼茶罗、法曼茶罗、羯磨曼茶罗、四印曼茶罗、一印曼茶罗。唯降三世曼茶罗具十曼茶罗，余皆具六曼茶罗。一切印契、一切法要，以四智印摄尽：大智印，以五相成本尊瑜伽；三昧耶印(以二手和合金刚缚發生成印)；法智印(名本尊种子法身三摩地一切契经文义)；羯磨智印(以二手金刚拳如执持器仗幖帜如身威仪形)。
又，瑜伽中四种眼：(敬爱法)、炽盛眼(钩召)、忿怒眼(降伏心杀害烦恼也)、慈悲眼(除毒息怨敌也)。
又一切如来教集瑜伽中，一百二十种护摩，依二十五种炉。于护摩炉中，契印幖帜各异，所求迅速成办。世间出世间成就果报，诸会浩汗文义稍多，恐文繁，且略指方隅，依《毘卢遮那成道经》，大本十万偈，可有三百卷经，唐国所译略本七卷。此经中，说一百六十心十缘生句，及五轮——地轮、水轮、火轮、风轮、空轮也。此经中，二种修行，菩提心以为因，大悲以为根本，方便为究竟，依胜义、世俗二谛：若依胜义修行，建立法身曼茶罗。是故此经中说，先称虚空中曼茶罗。是故观本尊法身，远离形色犹如虚空，住如是三摩地。若依世俗谛修行，依四轮以为曼茶罗：本尊圣者若黄色，住地轮曼茶罗(其形方名金轮)；圣者若白色，住水轮曼茶罗(其形圆名水轮)；圣者若赤色，住火轮曼茶罗(其形三角)；圣者若青、若黑，住风轮曼茶罗(其形如半月)。
大曼茶罗安于八叶莲花台，五佛、四菩萨安于台叶。中曼茶罗外，又有三种曼茶罗：一者一切如来曼茶罗；二者释迦牟尼曼茶罗；三者文殊师利曼茶罗。此曼茶罗，名为大悲胎藏曼茶罗，若弟子受灌顶法。小曼茶罗极微妙委曲，余部所不代。此中修行供养，兼存二种法，谓事与理为二也。
此经中护摩火天有四十种，就中一十二种火为最胜，炉形及木，有乳果类苦练，所用各不同。东西南北祈愿各殊，内外护摩亦依五轮，求四种事速疾成就——息灾、增益、降伏、敬爱。所请火天各各不同——寂静、熙怡、忿怒、喜怒，次第应知。
若《苏悉地经》，教中依三部，所谓佛部(五佛顶等)、莲花部种类甚多、金刚部金刚萨埵等，变化无量。
有三种三昧耶：佛部、莲花部、金刚部。
有三部心真言：
尔那尔迦(半音呼一) 阿𠰷力(二) 嚩日啰(二合)地叨(二合)(三)
部主有三种：金轮王佛顶佛部主、莲花部主马头观自在、金刚部主三世胜金刚。
三种部母：佛部佛眼以为部母、莲花部白衣观自在以为部母、金刚部忙么鷄菩萨以为部母。
三种明妃：佛部无能胜菩萨以为明妃、莲花部多罗菩萨以为明妃、金刚部金刚孙那利菩萨以为明妃。
三种忿怒：不动尊佛部忿怒、忿怒钩莲花部忿怒、军茶利金刚部忿怒。
有四种界：金刚橛地界、金刚墙八方界、金刚网上方界、密缝阿三莽儗儞界。
又有四种界，结护曼茶罗：金刚索护东方、金刚幢幡护西方、金刚迦利护南方、金刚峰护北方。又大界名商羯罗，设佛顶护轮王等隣近，不被障碍。此经中，修真言者成就世间悉地，依时依处。时者谓三时，处谓本尊像前。有供养五种，除阏伽：一者涂香、二者花鬘、三者烧香、四者饮食、五者灯明，白(北)、黄(东)、黑(南)、赤(西)，随息灾、增益、降伏、敬爱，所求应知。成就者十八种物随身，广如经说。
三时澡浴、三时换衣。一月分为四时：从月生一日至八日，应作息灾；从九日至十五日，应作增益；从十六日至二十三日，应作降伏；从二十四日至月尽日，为敬爱法。
《𪌘呬耶经》亦同苏悉地，说分布曼茶罗及絣地法。此经中极微细，不可具录。
又八方，其护持帝王营从兵法。五天竺国深敬信佛法，于帝王可传。《苏婆呼童子经》，此经中说办求成就人护摩。杵，金、银、铜、铁、石、水精、佉陀罗木等无量种各不同杵，五股、三股、一股。长十六指为上，十二指为中，八指为下，乃至一指节者为下。此经中说，不持金刚杵念诵者，无由得成就。金刚铃者，是般若波罗蜜义；金刚杵者是菩提心义，能坏断常二边，契合中道，有十六菩萨位，亦表十六空为中道。两边各有五股，五佛五智义，亦表十波罗蜜，能摧十种烦恼，成十种真如，便证十地。证金刚三摩地，获金刚智，坐金刚座，亦是一切智智，亦名如来自觉圣智。若不修此三摩地智，得成佛者，无有是处。恐文繁不能广述，若广释，穷劫不可说尽。
《怚唎三昧耶经》，同毘卢遮那集会。所有圣众修行教法，自性成就。此教中修行者，但住菩提心、大悲志愿，不舍无尽众生界。所不应事不可建、不可食，若为者犯三摩耶。此经中，说诵大轮金刚真言，不染诸愆过，以为方便，现生一切真言速疾成就。此经中不动尊等，四十二如来僮仆使者，若修真言行菩萨，坚持菩提心，我等承事供养拥护，食彼修行者残食。彼等至无上菩提，诸有作障者毘那夜迦不得其便，速证无上菩提。
