一　叙缘起

《药师经》，民国二十三年，太虚大师在宁波阿育王寺，曾讲过一次，法缘极盛，当时还记下一部很好的讲记。

我们的国家，多灾多难，特別是今年，大陆闹著空前未有的大水灾。我们来弘扬药师法门，是显得最有意义的。因为种种灾难，是由众生业力所招感，佛教本著解救众生苦难的慈悲立场，设有消灾法门，使众生消除业障，脱离灾难。本寺九月将启建药师法会，为上至元首下及军民人等祈祷，大家能消灾延寿，免难得福。所以在法会之前，先讲本经，了解得其中意义，将来大家參预法会，一方面仗三宝威力加被，一方面自己依法进修，才能真正达成消灾免难的目的——此是讲说本经的近因缘。

虚大师讲说本经时，说有三大因缘：一、近代人类重视现生安乐。现代人类所重视的是现实的人生，要求现实生活得理想、安乐。佛法所说的乐，有三种：(一)、现法乐，(二)、后世乐，(三)、究竟解脱乐。世间众生有种种苦痛的煎迫，所以要求出苦，倾向安乐；而一般所希求的安乐，总不外乎现生乐、后世乐、或是究竟解脱乐。这因为，众生的根性各异，生活于不同的时空裡，其所企求的安乐境界，也就有所不同。有的众生倾向后有乐，有的众生要求究竟解脱乐，而现代人类，则特別重视现法乐。释尊开创佛教，其基本精神，是导致众生同证究竟解脱乐，所以说佛法是出世的。然众生的要求不同，若但说究竟解脱乐，便不能普应那乐求不同的广大众生，因此释迦佛又开示东方净土的药师法门，与西方净土的弥陀法门。一般以为药师佛是延生的，阿弥陀佛是度亡的，其实这是通俗的说法。若根据佛法的正义来说，东方药师琉璃光如来的净土法门，是适应一类众生希求的现生乐；西方阿弥陀佛的净土法门，则是适应另一类众生所希求的后世乐。但这二者，都同以此为方便，引导趣入大乘，得究竟解脱为终极。

本来，无论西方极乐世界，或是东方净琉璃世界，我们谁也不晓得，都是释迦牟尼佛告诉我们才知道的，所以这都是释尊大悲救世的善巧方便。为了引导要求现法乐的众生，即示以东方药师的净土法门；为了引导要求后世乐的众生，即示以阿弥陀佛的净土法门，两者同为圆满究竟法门所流出的妙用。大师所以要特別倡导这药师法门，因一般佛教徒多偏重于西方的念佛法门，著重于死后的往生安乐土，每引起社会人士的误解。其实佛法是本于释尊的解脱乐，双开东西二净土，同弘现生后世乐。重现生乐的法门，事实上更适应于现代人类的根性，所以大师特为倡导，以适应现代人类，發挥佛法的大用。

二、东方净土与中国：佛说「从是西方过十万亿佛土，有世界名曰极乐」；同时又说从「东方去此过十殑伽沙等佛土，有世界名曰净琉璃」。释尊开示了二大法门，固然东方西方的净土，都有著真实意义，但释尊出生于印度，即就我们这小小的世界来看，也是异常适合，富有深长意义的。如印度以西的人，多倾向类似弥陀净土的思想；印度以东的人，又多类似药师净土的精神。这是说，从印度向西去，人民的宗教思想，无论回教或基督教，总是信仰一神，死后求生于天国，重于信仰及后法乐。故佛说西方净土，不但十万亿土外的极乐，印度以西的国家，如转秽为净，也是极乐净土式的，重视后生乐。自印度向东，如中国则不然，孔子说：「未知生，焉知死。」东方的文化思想，特別著重现生乐，实与药师佛的净土相近。所以此经最能适应中国人心。

三、依药师净土创建人间净土：我们对于药师法门，平时只著重消灾延寿，而不知药师如来在过去生中，曾發菩提心，發广大愿，行大悲行，而后才成就无上佛果，成就清净光明的琉璃世界。关于这，经裡说得极其详细，我们參加药师法会，应该一面祈求药师如来恩德的加被，一面依佛因地所發的大愿，所行的悲行，照著去躬行实践，以资自净化他，完成人间净土。民国二十二年，戴季陶院长，于宝华山启建药师法会，领导大众如药师佛那样發十二大愿。如能依此大愿去实行，不但个己小小灾难可以消除，就是整个国家社会甚至整个世界，也可转为庄严净土。因药师的东方净土，即是依其本愿功德而实现的。我们若能实践此一法门，那么，我们这个充满无边苦难的恶浊世界，面临危难的中华民国，不就可转成清净的净琉璃世界吗？所以我们听讲此经，应如此理解与实行，而祈求人间净土的建立。

二　释经题

本经的经题，据佛说有三个名称：一、药师琉璃光如来本愿功德；二、十二神将饶益有情结愿神咒；三、拔除一切业障。现在流通的本经，是以第一名称为经题。因为拔一切业障，就是药师如来本愿功德的力量；十二神将的饶益有情，也只是护持药师如来的功德法，而令有情获得此功德的法益。所以以本摄末，立名为药师琉璃光如来本愿功德经。

「药师」：现代谈到药师，只是配药的人，而古代却不然，药师与医生的含义一样。佛法中常称佛陀为无上医王或大药师，因佛能治疗一切众生的种种疾病。经裡说：人的生理上有三种病——老、病、死；心理上也有三种病——贪、嗔、痴。大觉佛陀出世救济众生，即是为了拔除众生身心的种种病患，故赞叹佛为大医王、大药师。我们不可把含有崇高意义的药师一名，视为普通的配药人。

什么是病？什么是药？病，即是由于不调和所起的现象，如经说：「一大不调，百一病生。」人的身体，某一部分不调和，即会有病，更会影响到全身的不调和。心的不调也是这样，我们心理若是有点反常现象，或是有了某种烦恼，便会牵连及全部精神的不安。如此说来，世间的病患就多了，从各个众生的身心，而扩大到家国、社会乃至整个世界，莫不病患重重。如一个家庭，若父子夫妻兄弟姊妹不调和，此一家庭就是有病；一个团体中的组织分子不调和，此一团体也即有病；再扩大言之，政治不上轨道，是国家病；人类不相调协，是世界病。有病即有苦，所以种种灾难，种种苦痛，无一不是导致于冲突不和而产生的病态。在个己方面，我们平常也许会自以为没有病，其实依佛法说，「人生无有不病时」，不过微而不觉罢了。人生从来离不了病。我们既生而为人，则必定有身有心，有五脏六腑等生理组织，而这些组织因素，时时發生矛盾，时时都在病中。不过若能使它倾向于调和，调和的成分多，身体就称为健康。从这个意义去看，世间的一切，有痛苦，有灾难，即无非是病。

众生有病，便需治之以药。世间的医药以及政治法律等，都可说是药；但在佛法中，药就是佛法——法药。唯有佛法方能疗治一切疾病。刚才说，病有身心、家庭、团体、国家、世界等不同病态；凡能够减除苦痛，使苦痛变成安乐的，都是药，因此可说世间什么都是药，处处都有药，不过我们不知，若懂得了就什么皆可治病。过去有位学医的，将要毕业的时候，医师为欲考验他的学力如何，便命他上山采药，要他见了药都采了来。结果他去了一天，仍然空手回来。医师问他何故空手而归？他说满山的树木花草，土石沙砾，样样是药；药太多了，叫我从何采起！这是说，世间一切都是药，都可以治病，问题在用药的人是否理解药性，会不会应病与药。佛法是不定法，众生有种种病，佛就用种种法药去对治，因为佛法是依众生的病而施设的，所以说众生有八万四千烦恼，佛说八万四千法门。有了什么病，就治以什么药，若拘执为这是药那不是药，那就离佛法远了。

关于药与病，已如上所说，现在再谈能知病源能应用药的人——药师。佛法说有两种药师：一为小药师，一为大药师。小药师的医术不太高明，药箱裡也只有一两样药，只能治疗一两种病；大药师就不同，他的药箱裡具备了种种药，应有尽有，而且医术高明，能深察病情，精用药物。这喻诸佛菩萨，圆具精深的智慧，宏伟的愿力，广大的悲行，有种种法门，种种的妙药，众生有什么病即能治以什么药，千变万化奇形怪状的病患，配以千差万殊的药方，皆能运用自如，从无差错；决非偏执一方一法的小药师可比。

药师治病，有标治与本治的不同，头痛治头，脚患医脚，是标治；探究病源以彻底根除病患，是本治。顶好的医治，是一面培养元气，一面预防足以致病的因素，也即是治于未然，这才是上等治法。在心理方面，如教以正当知见，信因果，信三宝；在生理健康方面，教以重视卫生，勤于运动，善自调摄。身心若预先调好，根本不会生病。如果不预先防备，而待病發之后才用药治好，已是下等治法。这虽是必须的，但到底不及前者。俗语说：「刀伤药虽好，不割更妙。」讲究治本的，是培养身心的健康，使各部平衡發展，消除疾病的因素。治家病、治国病，也如此。如病發生以后才去医治，实已迟了一著。上等药师无不标本兼治，问题还是在病人本身，如医生教他注重卫生，预防病素，他不听，结果才病倒下来。

佛给众生治病，也有治标治本二法。归依三宝之后，能依教法而按步进修，从愿行中慢慢地体验。种种烦恼，种种苦痛，自然就会由减少而终至完全根绝，以达最高理想的实现。但普通人不能如此，不知平时进修，善的不保留，不扩充；坏的不减除，反而与日俱增。身心不知调摄，家事不善处置，国事不善治理，弄得毛病發作，痛苦无边！佛法为救治众生身心的种种病苦，故有消灾免难的标治法门。在病人，虽不免被讥为：「平时不烧香，临时抱佛脚。」然能猛自回头，急求三宝加被，还不失消灾得乐的时机。只怕不认病，不求医，那才死而后已。所以，能切实依教奉行，苦难不消而自消，福慧不增而自增。欲求免难延寿消灾障，大家要奉行本标兼治。

依照佛陀治病的方便，还可分为二：一正治，二奇治。正治，是一般的治疗法；奇治，是特殊的治疗法。毒药是害人的，但真正的名医，砒石也可当药，这是特殊的奇治。但奇治不易，每会發生危险，而一般的治法则较为稳当、安全，不致引生意外。佛的治法也有正常道和特殊办法，如佛说无我，是根本正治；但有些众生不能了解，心生恐怖，或是曲解佛意，抹煞因果，向恶拒善，佛于是不得不又说有我，以正其偏弊。这类正用反用，种种慈济众生的方便，不胜枚举。总之，全视众生患何种病，即治以何种药。正路虽远而平坦易行，曲道虽近而崎岖危险。这点，修学佛法的人，非首先了解不可。

药师，本可为一切佛的通称，佛都能善治众生病的。佛体察众生的种种病情，能施设运用种种法药——八万四千法门，即是八万四千法药。如作大类的分別：有人天法药，小乘法药，以及自利利他的菩萨法药等。约此意义，一切诸佛都是无上医王，都是大药师。不过东方净土的如来，特別重视消灾免难，特重于治理众生身病，所以特以药师为名。究竟的无上的药师，唯是佛陀，而佛弟子依佛教法修学，或自学，或讲说以利化，多少学习了佛陀的法药，多少救治众生的病苦，也可以称为药师。

「琉璃光」：也是东方佛的名字。此中所说的琉璃，不是琉璃灯、琉璃瓦等琉璃，而是梵语薜琉璃的略译，是一种宝物。颜色如万里无云的碧空，又如澄清深彻的海水；体质坚固，如金刚石，为极希有的珍宝。这是以琉璃宝的光辉、明净，而比喻佛德，所以东方药师佛，又以琉璃光为名。

琉璃宝，或释作远山宝。依佛教说，我们的这一世界，当中是须弥山，山的周围有四大部洲，须弥山的四峰皆是宝类所成。南赡部洲所对的山峰，即琉璃宝积聚而成。此宝山光辉映入空际，遂呈青色，故琉璃义译为远山宝。现代科学家，对于天空何以会呈现青色，当然有他的解说。而佛出印度，取印度当时的见解，解说为由于琉璃宝光的反映。

佛与菩萨，皆是依德立名。但佛德崇高，没有完美适当的，所以只能从佛（自利或利他）德的某特性，或用譬喻来勉强诠示。如须弥山王佛，是以巍峨高大的山王，比拟佛德的伟大崇高；如栴檀香佛，因佛的德香远闻，故以栴檀香立名；又如雷音王佛，形容佛的法音远震，如空中的雷音一样，震撼世界。佛的名号，以德或从譬喻安立，这裡的琉璃光，也是从比类来赞佛的德性。

琉璃光的含义，现在略说两点：一、依众生的心境说：本经以东方佛土为净琉璃世界，佛名琉璃光如来；辅佛宣扬正法的，是日光遍照和月光遍照二菩萨。前面说过，琉璃宝即是远山宝，琉璃光系由远山宝映现于空际的光彩；而今此二菩萨，以名喻德，当然如日月行空，普照一切。众生——人类在生死轮回的过程中，都有一种向上向光明的趣向和要求；佛陀随应众生的心境，也就以明净的青天与日月，表征如来的德性。向上向光明的趣求，是人类普遍而本能的共同希望；佛教，固然是倾向于真理与光明，即一般的低级宗教，也同样向上向光明的。多神教中，崇拜太阳、月亮；基督教的上帝，虽说无形无像，而见上帝的也是赫赫的光明；又如印度宗教有天的崇拜，天（梵语提婆）的意义，也就是光明。所以人类对于日月光辉或明净空界的景仰，只是渴求光明与明净的内心表现。人类的本性便是向光明的，不过如知识幼稚的，信（太阳月亮）神，信鬼，而不能自觉景仰光明的真实意义——归向于佛陀，引發而实现佛性的明净。所以药师法门，即以青天与日月的光明，表征佛菩萨的功德，显示人类最高的理想界。

世间的光明，无过于日光和月光。此二种光明，同是清净的，象征希望与幸福的。然多少也有些不同，大致说来，日光是温暖的，富有热力的，一切的一切，在日光朗照下，都能明显地發露出来。这喻如智慧的光明，能给予世间以热力，能透过蒙昧，灼照一切，通达世出世法的真相。月光呢，它是清凉的，安宁的，幽静的；它在黑夜中放出皎洁清辉，引导人们走上正路，避诸险难，具有大悲慈济的意义。太阳光给人以热力、光明、幸福和希望；月亮给人以清凉、安宁、幽静的境界。光和热，能够激發我们奋發向上；而清凉与宁静，足以陶冶我们的性灵，获得自在与安定——这都为人生所必须的。

现实世界，人人都有倾向光明的意欲，人生要有光明的人生，社会也要有光明的社会。中国古有「光天化日」四字，形容光明的社会。现在中华民国，以青天白日满地红的标帜为国旗，象征著我们的国家民族，将在青天白日之下自由平等地过著光明幸福的生活。唐朝武则天皇帝，有以佛教思想导入政治的抱负；她想使政治走上正轨，人民得以过著幸福康乐的生活，所以她特別造了「曌」字，作为自己的名号；「曌」读为照，便是日月临空的意思。由此可见她是怎样地憧憬著光明幸福的远景！然而，以上所列举的是一般人类的光明倾向；真能引导我们达到终极目标，使我们达到究竟的光明的人生境地，唯是佛法。故唯有大家向佛法的大道上走，才能完成究竟圆满的人生，才能使我们达于永久光明、无限光明的境界。

二、约佛陀的证境说：佛的自证境界，本是不可以心思口议，平等平等，无有差別，离一切相的。约从离无明暗翳而显证说，称佛的自证境界为最清净法界，犹如净虚空；或称毕竟空，或称空性，都从现证的真性说。琉璃光，即佛的自觉境界。如如智契如如理，在平等一法界中，显發无边光明（清净功德），朗耀皎洁，平等无差別，不是混混沌沌黑漆一团，故喻佛的自证境为琉璃光。佛果的圆满境界，实在不可思议，不可言说，所以经中每以菩萨的因德，表达如来的果德。如毘卢遮那佛（也是光明遍照意），以文殊、普贤二大士，表彰佛陀的大智与大行。或以四大菩萨，表彰佛的悲（观音）、智（文殊）、行（普贤）、愿（地藏）。本经以日光遍照、月光遍照二菩萨，表彰药师佛的大智慧（日）与大慈悲（月），如日月光辉的遍照世间，普济一切。如来所有的无量无边功德，在这二大菩萨的德性中，充分的表现出来。因此，药师佛又名琉璃光，他的国土是净琉璃世界，菩萨为日月光遍照，是具此一番深义的。东方净琉璃世界，表佛现证的清净法界；琉璃光，表无上菩提契证法界的德性；琉璃光（青天）是本体，日月运行于青天，放播光明，可说为从琉璃光而起的妙用。中国人一向重视太阳，对月亮却缺乏欣赏，所以重视温暖，热力，光明，希望，而说「光天化日」等。然印度却特別对月亮發生兴趣，「印度」，即可解说为月亮；印度的文化思想（佛教也在内），皆特重于宁静、清凉的特德。近年来，世界局势越来越紧张，文化思潮愈来愈汹涌，宁静清凉的人生性德，也就越来越没落了。本来，动与静，热烈与安静，强光与微明，温暖与清凉，应互相协调而求平衡，这对于人性的發展，世局的安定，都是十分切需的。我们学佛，从凡夫到达圣者——佛的境界，必發挥这两面的德性；对治人世的嚣狂凌乱，应重视清凉与宁静。药师琉璃光如来，对此有著充分的圆满的表现，所以，能为人世一切苦难病患的救治者。

次解「如来」：药师琉璃光是一佛的专名，如来是诸佛的通名，凡证获无上佛果的，皆可通称如来。梵语怛陀阿伽陀，有三义：即如来、如解、如说。(一)、如来，如，是一模一样，没有差別的意思。菩萨到了功行圆满，以最高的智慧，体证了究竟的真理，此真理就是如；佛是契此平等不二真如而来，故名如来。(二)、如解，佛有无上的智慧，对世出世间的一切法相，无不正确通达，毫无颠倒错乱，如法的实相而解了，是名如解。(三)、如说，佛陀不仅是解悟正确，就是说法也如实而说。应该如何说就如何说，有如实说有，无如实说无，说得都恰到好处，故经裡称佛为实语者，如语者，不诳语者，不异语者。如来、如解、如说，是佛陀所有的功德；译者因不能遍译三义，所以都译为如来。

「本愿功德」：愿是愿欲，本愿即菩萨因地所發的弘愿。修学佛法，以發愿为先，可说为成佛的根本。菩萨在因地所發誓愿，有通有別，如愿成佛道，愿度众生；及「众生无边誓愿度」等四弘誓愿，名为通愿，是每一菩萨都如此發的。如阿弥陀佛在因地中發四十八愿，药师佛因地的十二大愿，便是別愿。大家別误会，以为發愿多，功德就大，發愿少，功德就小；要知道诸佛愿力，是平等平等的。愿是凡夫趋证佛果的动力，若无愿，便什么也不得成。不独修学大乘法门，即学小乘法，无愿也同样不能成就。所以修学菩萨，首先必须立定志愿，然后从愿起行，依行得证。阿弥陀佛和药师佛在菩萨因地，發广大愿；行到目的地时，愿也就圆满成就了。本经题但出本愿功德，而经裡却说到广大行，可见行是实践志愿的心要了。我们每天都發愿，但大都發愿而不能付诸实行，所以不能实现学佛——自利利人的目的。

功德，不但是在寺院裡做些佛事。功是功力，如行布施、持戒、忍辱、礼佛、坐禅等，都要有一番功力。德即是得，修行而得成绩，做一分得一分，名为功德。依本愿去实践，所成就的功德，称为本愿功德。

「经」：梵语修多罗，本义为贯串摄持的线。释尊在世，随机说法，现今集成为一段一章，一部部的经典，是佛灭度后，弟子们结集成的。各类的法门，有组织地贯串起来，像一朵朵的花，用线贯穿而成花鬘，便不会散失。经也这样，佛在世时随时随地说法，若不加以编集，就难得保存于久远了。佛说的法，是究竟的真理与德行，可给我们永久学习，永久依循，所以经又含有恒常法则的意义。佛说的名为经，佛弟子的述说，不名经而名论，这是表示尊重佛说。如中国古典而有价值的，如书、诗、易等，也叫做经。

以上，对经题作分別的解释，现在把它综合起来：经是一切佛经的总名，是能诠教法；药师琉璃光如来本愿功德，是本经的別名，是所诠表的理行果法。所诠法中，本愿功德，约因地行愿说；药师琉璃光如来，约果德说。果德中，如来，是一切佛的通称；药师琉璃光，是本经东方佛土教主的別名。別名中，药师喻佛的大慈悲；琉璃光显佛的大智慧。经题有因、果，悲、智；下面经文，即对于悲智因果等，作圆满的开示。

三　明翻译

佛法虽说在不同的区域，为不同的众生说，但释尊出生于印度，一切佛经都是以印度文字集录的。以印度文编成的经典，必须译成华文，我们始能理解。所以从事译经工作，极为重要，过去多少大德，都献身为译经事业而努力。像本经的译者玄奘三藏，在我国的翻译史上，就有辉煌的功绩。

本经传来中国，共有五次翻译。第一译，为东晋帛尸梨密多罗三藏所译，经名《佛说灌顶拔除过罪生死得度经》。唯此并无单行本，系附于《佛说灌顶大神咒经》中；《灌顶经》属于密部的法典，有十二卷，本经为最后一卷。尸梨密多罗，此云吉祥友；帛，是龟兹国的王家姓，所以帛尸梨密多罗三藏，大抵是龟兹国人。第二译，是刘宋慧简法师所译，名为《药师琉璃光经》，今已失传。据古人说，此译文义，并不十分圆满。第三译，为隋炀帝时达磨笈多译，名《佛说药师如来本愿经》，经本现存。达磨笈多，此云法藏或法护，他曾译无著的《摄大乘论》、《金刚经论》，可说是一位唯识学者。但非他一人独译，还有助译人，所以题作达磨笈多等译。第四译，就是现今的讲本，系唐朝玄奘三藏所译。第五译，是唐武则天时代的义净法师所译，大约迟奘法师二三十年。义净法师从广州出發，循海路经越南、锡兰等地，也经历许多艰难始达印度，遍访全印的著名学者；回国后译出此经，名《佛说药师琉璃光七佛如来本愿功德经》，共二卷，内容较前四译为广。

现在所据的讲本，是玄奘法师译的。谈到奘法师，可说妇孺皆知，不过一般对于奘师的传闻，大多从《西游记》中得来，离奇怪诞而不符史实。我们要知正确可靠的历史，可读藏经中的《慈恩三藏传》。奘师河南人，出家后遍參名德，研究经论，發现中国传译的经典有许多出入，义理也有可疑处，使后学者无从依据。为要从印度探求圆满的佛法，于是毅然远游印度，在印留学十七年，到过一百多个国家，遍学大小圣典，至唐太宗贞观十九年，始负经归国。当时，上自皇室，下至庶民，无不热烈欢迎，恭敬礼拜。归国后，即致力于译事，译出了大量的经典，为译经史上写下不可磨灭的一页！

《西游记》说，唐僧西天取经，曾历九九八十一难，吃尽人间辛苦。事实虽不如此，但在往返的旅途中，经沙漠，越高岭，确也吃了不少苦头。像奘法师等古德，为什么要受尽那许多艰辛险难，而到印度去求经？这因为，他知道佛法能够救济众生，使众生离苦得乐；因此，他不避险难，置生死于度外，由大悲心的驱使，希望成就众生，就是牺牲了自己也无所谓。古诗云「去者成百归无十」，可见取经的艰难危险！所以译出的经典，完全是古德用自己的生命换来的，我们现在能够读到这些圣典，应该饮水思源，感念古德的恩德。

「唐」是唐朝，国王姓李。「三藏」是经、律、论三藏，奘法师能博通三藏教典，故尊称为三藏「法师」。此经是奉皇帝的意旨而译出来的，所以又说「奉诏译」。

现在要略辨五译的同异：本经的前四译，大致相同，只有义净译稍异。前者只说药师净土，义净译则有七佛净土。如说「东方去此，过四殑伽河沙佛土，有世界名曰无胜，佛号善名称吉祥王如来……」；乃至「东方去此，过九殑伽河沙佛土，有世界名曰善住宝海，佛号法海胜慧游戏神通如来……」。这其中六段，都与前四译不同。到了说到药师如来的净土，就与四译相同。但同中又有稍异：(一)、前四种译本，在佛宣说神咒之后，只说大众得闻药师佛名而获利益，义净译则说闻七佛名而得益。(二)、义净译药叉神将闻了七佛名号發愿护法，及时诸人众起，七佛应召来会证明其事等文，为其余译本所无。(三)、义净译多了七佛说咒，名定力琉璃光。(四)、奘译没有金刚及梵释诸天各说咒语。现存所依的玄奘译本，其中药师如来所说的神咒一段，也是从义净译录出而插进去的。但帛尸梨密多罗所译也有咒语，不过不是在当中，而是附于经末。关于这点，太虚大师曾有论到：佛法，不独小乘，即大乘也是因地而异，因时而异。比方佛灭度百年后，小乘蓬勃，大乘隐晦；从五百至八百年间，大乘盛行，密教还不大兴盛；后来才慢慢活跃起来，这是因时而异。第一译者帛尸梨密多罗三藏，是龟兹人；密法早就流传在龟兹，所以他就编译《大灌顶神咒经》。义净到印度时，正是印度密典盛行的时代，故义净三藏译出的本典，密宗的色彩较重，奘公及达磨笈多等则较少。

这裡附带一谈净土法门与秘密法门的关系。在过去，有些净土行者，不满意密教；而密教学者，也多少轻视净土；其实净与密，关系最为密切，其性质也最为接近。比方本经，若除却咒语，便纯粹是净土法门；加上了咒语，便又通于密部。又如《阿弥陀经》，是纯净土法典；但如「拔一切业障根本得生净土陀罗尼」，也就通于密部。这与本经相同，本经药师所说咒，也是拔除一切业障。还有，不论净土或秘密教，佛或本尊，其加被力最受重视。如阿弥陀佛的愿力，或药师如来的本愿力，都极重要；而行者对于佛或本尊的不可思议力，更须要具足充分的信心，绝不容许有丝毫的疑念。又密部的念咒和净土的念佛，同是以口發音声，作为修行的方便。密宗修观，观想其崇拜的对象——本尊，如大日如来、观音、文殊等菩萨；不动、阎鬘德迦等金刚，到观行成就，本尊现前，即可与自己晤谈，开示法语。净土法门的念佛观修成，佛也同样可以现前，如《般舟三昧经》说。这二类法门，非常相近。如现讲的《药师经》，教我们诵经，念佛，或持咒，可说都是属于显教的修行法。金刚智，不空，一行三藏等密教大师，都曾有药师仪轨；所以本经，通于净土及秘密法门，通于显、密二教。